Подскажите как лучше реализовать:

Есть однажды написанный алгоритм: Получает остатки товаров, по списку из документа, и разносит табличную часть по количеству в документе.

Очень бы хотелось сделать так:
В локальном контексте описываем две функции:
1. Функция ПроверкаПартии() - для описания сравнения реквизитов конкретного документа с таблицей остатков
2. Функция ПроводкаПоСтроке() - для описания проводок по одной строке (остатков или документа)

3. ОбработкаПроведения - выглядит так:
        //**начальная инициализация
        СписатьСОстатков(Контекст,Склад,Счет...и т.д)

4.   СписатьСОстатков(Конт,Склад,Счет...и т.д)
         //**всякие циклы и условия - которые обычно тупо копирую в документы
         //И такая строка:
         Если Конт.ПроверкаПартии(....) = 1 Тогда
                Конт.ПроводкаПоСтроке(....);
         КонецЕсли;
       
Понимаю, что этот функционал тянется еще из турбобубл, насколько работоспособен вызов функции контекста при проведении документа, и какие могут быть грабли?

Посмотри в сторону классов. Полиморфизм тут в полный рост.

А, да, понятно.
СписатьСОстатков - наверное, находится в ГМ.

Да наверное будет работать, хотя именно для контекстов модулей проведения не проверял.
Через Делегат тоже, наверное, будет работать.

И Федор дело говорит, еще можно этот функционал вынести в классы.