Есть такой запрос
ТекстЗапроса = "
     |SELECT ПартииТоваровОстатки.Склад [Склад $Справочник.МестаХранения]
     |      , (ПартииТоваровОстатки.ОстатокТовараОстаток) ОстКол
     |      , (ПартииТоваровОстатки.СебестоимостьОстаток) ОстСС
     |      , (ПартииТоваровОстатки.ОстатокТовараОстаток * $ПоследнееЗначение.Цены.Цена(Цены.ID, :ВыбДата)) ОстОЦ
     |      , (РезервыТоваровОстатки.РезервТовараОстаток) РезКол            
     |      , (РезервыТоваровОстатки.РезервТовараОстаток * ПартииТоваровОстатки.СебестоимостьОстаток / ПартииТоваровОстатки.ОстатокТовараОстаток) РезСС
     |      , (РезервыТоваровОстатки.РезервТовараОстаток * $ПоследнееЗначение.Цены.Цена(Цены.ID, :ВыбДата)) РезОЦ
     |FROM $Справочник.Цены AS Цены
     |      FULL JOIN $РегистрОстатки.ПартииТоваров(:ВыбДата~,,
     |            (Фирма = :ВыбФирма),
     |            (Склад, Фирма, Товар, Партия),
     |            (ОстатокТовара, Себестоимость)) AS ПартииТоваровОстатки
     |      ON Цены.PARENTEXT = ПартииТоваровОстатки.Товар
     |      FULL JOIN $РегистрОстатки.РезервыТоваров(:ВыбДата~,,
     |            (Фирма = :ВыбФирма),
     |            (Фирма, Товар, Склад, Партия),) AS РезервыТоваровОстатки
     |      ON ПартииТоваровОстатки.Товар = РезервыТоваровОстатки.Товар
     |      AND ПартииТоваровОстатки.Фирма = РезервыТоваровОстатки.Фирма
     |      AND ПартииТоваровОстатки.Склад = РезервыТоваровОстатки.Склад
     |      AND ПартииТоваровОстатки.Партия = РезервыТоваровОстатки.Партия
     |WHERE ($Цены.ТипЦен = :ТипЦен) AND ($Цены.Фирма = :ВыбФирма)            
     |";

Хочу сгруппировать по Складу, ставлю
GROUP BY ПартииТоваровОстатки.Склад
и соответственно добавляю SUM, но не хочет SUM работать с периодическими реквизитами справочника, как быть?

Не настолько силен в скриптах 1С++, но мне так кажеться что full join делать не надо (как первій так и второй). Можно сделать подзапросы. Хотя надо смотреть на реалтный запрос что посылает 1С++ через профайлер.